1. Может, но в пределах одного компьютера.
2. Да. У меня был вырус, который автоматом каждые 20 секунд прописывался на все внешние носители.
3. да, такое может быть. В университете у нас есть аудитория, в которой стоит только вставить флешку в комп (не открывая), принесешь домой штук 6 новых питомцев.
4. да, есть такие. Черви - так те вообще по Интернету ползают и собирают всякую пакость.
1. Да, легко. Вирусы (вредоносные программы, внеряющие себя в чужие исполняемые файлы) нередко заражают подряд все запускающиеся программы. Трояны (вредоносные программы, существующие сами по себе), тоже вполне могут создать себе несколько "гнёзд". Например, трояны, распространяющиеся через механизм автозапуска.
2. Да, такое вполне вероятно, если флэшка не защищена от записи (против примитивных поделок на VBS вполне помогает создание в корневом каталоге скрытой системной readonly папки с именем autorun.inf, хотя это, разумеется, не даёт гарантии).
3. Да, если активен механизм автозапуска. Его можно отключить через реестр (рекомендуется), или просто зажимать шифт пока вставляешь флэшку (не отпускать, пока она не определится).
4. Скорее да, чем нет.
1) Вирусы - да. Создавать свои копии и помещать их в другие программы - это их основная цель. Трояны обычно нет, хотя они могут пытаться рапространять себя. Например, на другие машины в локальной сети (если она есть).
2) Очень часто вредоносное ПО оснащается модулем-downloader'ом, который позволяет ему скачивать из Сети новые компоненты и запускать их. В этом случае на компьютер попадают уже совсем другие образчики вредоносного ПО.
3) В целях собственной безопасности более-менее профессионально написанное вредоносное ПО "оглушает" установленный на компьютере антивирус и файрволл(брандмауэр). Этим оно невольно открывает дорогу для более примитивных видов, которые обычно не имели бы шанса закрепиться на данном компьютере. Грубо говоря, как СПИД - убивает иммунную систему, а потом налетевшая орда обычных микробов убивает лишившийся защиты организм.
Так что "зоопарки" вирусов более вероятны.